MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halobacillus halophilus DSM 2266 plasmid PL3

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017670	GAT	2	6	2	7	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017670	TGAA	2	8	68	75	50 %	25 %	25 %	0 %	386118365
3	NC_017670	AAAG	2	8	115	122	75 %	0 %	25 %	0 %	386118365
4	NC_017670	GAAT	2	8	203	210	50 %	25 %	25 %	0 %	386118365
5	NC_017670	ATA	2	6	335	340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386118365
6	NC_017670	T	6	6	508	513	0 %	100 %	0 %	0 %	386118365
7	NC_017670	ATA	2	6	569	574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386118365
8	NC_017670	ATC	2	6	638	643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386118365
9	NC_017670	TAC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386118365
10	NC_017670	ATT	2	6	752	757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386118365
11	NC_017670	GTA	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386118365
12	NC_017670	GAA	2	6	774	779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386118365
13	NC_017670	AGA	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386118365
14	NC_017670	TCA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386118365
15	NC_017670	TGC	2	6	954	959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386118365
16	NC_017670	TAAT	2	8	1049	1056	50 %	50 %	0 %	0 %	386118365
17	NC_017670	T	7	7	1182	1188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017670	TTA	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017670	GAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017670	TCT	2	6	1327	1332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386118366
21	NC_017670	A	6	6	1429	1434	100 %	0 %	0 %	0 %	386118366
22	NC_017670	AGCG	2	8	1538	1545	25 %	0 %	50 %	25 %	386118366
23	NC_017670	ATT	2	6	1591	1596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386118366
24	NC_017670	GAA	2	6	1616	1621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386118366
25	NC_017670	T	6	6	1622	1627	0 %	100 %	0 %	0 %	386118366
26	NC_017670	TGA	2	6	1636	1641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386118366
27	NC_017670	A	6	6	1767	1772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017670	T	8	8	1804	1811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017670	T	6	6	1822	1827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017670	AGC	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017670	A	6	6	1889	1894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017670	A	7	7	1913	1919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017670	TG	3	6	1940	1945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017670	T	6	6	1947	1952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017670	TCGT	2	8	2002	2009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017670	TAAA	2	8	2010	2017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017670	CTT	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017670	GATCT	2	10	2139	2148	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017670	T	6	6	2159	2164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017670	TCT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017670	GAG	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017670	T	7	7	2239	2245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017670	TTTA	2	8	2248	2255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017670	TTGT	2	8	2269	2276	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017670	TAACA	2	10	2303	2312	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017670	AGTTA	2	10	2355	2364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017670	ATA	2	6	2440	2445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017670	GGCTG	2	10	2527	2536	0 %	20 %	60 %	20 %	386118367
49	NC_017670	T	8	8	2560	2567	0 %	100 %	0 %	0 %	386118367
50	NC_017670	AG	3	6	2582	2587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017670	T	7	7	2616	2622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017670	A	6	6	2628	2633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017670	AAAG	2	8	2653	2660	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017670	TTTTA	2	10	2674	2683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017670	A	7	7	2714	2720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017670	TTG	2	6	2727	2732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017670	GGGGT	2	10	2791	2800	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017670	CAA	2	6	2837	2842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017670	T	7	7	2852	2858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017670	TAA	2	6	2862	2867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017670	T	6	6	2951	2956	0 %	100 %	0 %	0 %	386118368
62	NC_017670	GTT	2	6	2960	2965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386118368
63	NC_017670	AGA	3	9	3068	3076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386118368
64	NC_017670	GAT	2	6	3087	3092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386118368
65	NC_017670	A	6	6	3094	3099	100 %	0 %	0 %	0 %	386118368
66	NC_017670	T	6	6	3116	3121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017670	TTGAT	2	10	3198	3207	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017670	A	6	6	3220	3225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017670	TGG	2	6	3229	3234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017670	A	6	6	3239	3244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017670	GTTATG	2	12	3253	3264	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017670	TGA	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.